Situé Boulevard Tonnellé, face à l'hôpital Bretonneau, le Jardin Botanique (5ha) est le plus ancien jardin public de Tours, réalisé en 1843 à l’initiative du pharmacien Jean-Anthyme Margueron (1771-1848) sur l’ancien lit du ruau Sainte Anne. Grâce à la création de l’Hospice Général et de l’Ecole Préparatoire de Pharmacie, le jardin est conçu comme un jardin de plantes médicinales..
En 1848 et surtout en 1856, le Jardin Botanique est inondé par les crues de la Loire(2 m. d’eau dans les serres). En 1863, un parc animalier et une orangerie sont aménagés. En 1890, des serres chaudes, tempérées et froides sont ajoutées à l’orangerie. En 1901, le premier catalogue de graines est édité.En 1944, les serres et la chaufferie sont fortement endommagées par les bombardements.
C’est à partir de 1980 que la partie nord fut rénovée en jardin phyllogénétique et en jardins à thèmes. Le Jardin Botanique comprend l’arboretum avec de beaux arbres remarquables (arbre aux quarante écus, séquoia géant, cyprès chauve, orme d’Amérique, sophora du Japon), un espace animalier avec mini basse-cour, flamants roses, les volières et le jardin médicinal complètent l’arboretum. Côté nord on trouve le jardin phyllogénétique et les jardins à thèmes. A l’extrémité nord, l’orangerie abrite les plantes tropicales. Les collections du Jardin Botanique comptent plus de 2000 taxons qui sont gérés par la faculté de pharmacie et le service des parcs et jardins.